BEAGLE
An Application Programming Interface and High-Performance Computing Library for Statistical Phylogenetics
Here is a list of all documented file members with links to the documentation:
- b -
BEAGLE_ERROR_FLOATING_POINT :
beagle.h
BEAGLE_ERROR_GENERAL :
beagle.h
BEAGLE_ERROR_NO_IMPLEMENTATION :
beagle.h
BEAGLE_ERROR_NO_RESOURCE :
beagle.h
BEAGLE_ERROR_OUT_OF_MEMORY :
beagle.h
BEAGLE_ERROR_OUT_OF_RANGE :
beagle.h
BEAGLE_ERROR_UNIDENTIFIED_EXCEPTION :
beagle.h
BEAGLE_ERROR_UNINITIALIZED_INSTANCE :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_COMPUTATION_ASYNCH :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_COMPUTATION_SYNCH :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_EIGEN_COMPLEX :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_EIGEN_REAL :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_FRAMEWORK_CPU :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_FRAMEWORK_CUDA :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_FRAMEWORK_OPENCL :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_INVEVEC_STANDARD :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_INVEVEC_TRANSPOSED :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_PARALLELOPS_GRID :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_PARALLELOPS_STREAMS :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_PRECISION_DOUBLE :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_PRECISION_SINGLE :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_PROCESSOR_CELL :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_PROCESSOR_CPU :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_PROCESSOR_FPGA :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_PROCESSOR_GPU :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_PROCESSOR_OTHER :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_PROCESSOR_PHI :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_SCALERS_LOG :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_SCALERS_RAW :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_SCALING_ALWAYS :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_SCALING_AUTO :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_SCALING_DYNAMIC :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_SCALING_MANUAL :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_THREADING_CPP :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_THREADING_NONE :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_THREADING_OPENMP :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_VECTOR_AVX :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_VECTOR_NONE :
beagle.h
BEAGLE_FLAG_VECTOR_SSE :
beagle.h
BEAGLE_OP_COUNT :
beagle.h
BEAGLE_OP_NONE :
beagle.h
BEAGLE_PARTITION_OP_COUNT :
beagle.h
BEAGLE_SUCCESS :
beagle.h
beagleAccumulateScaleFactors() :
beagle.h
beagleAccumulateScaleFactorsByPartition() :
beagle.h
beagleCalculateEdgeLogLikelihoods() :
beagle.h
beagleCalculateEdgeLogLikelihoodsByPartition() :
beagle.h
beagleCalculateRootLogLikelihoods() :
beagle.h
beagleCalculateRootLogLikelihoodsByPartition() :
beagle.h
beagleConvolveTransitionMatrices() :
beagle.h
beagleCopyScaleFactors() :
beagle.h
beagleCreateInstance() :
beagle.h
beagleFinalize() :
beagle.h
beagleFinalizeInstance() :
beagle.h
BeagleFlags :
beagle.h
beagleGetCitation() :
beagle.h
beagleGetPartials() :
beagle.h
beagleGetResourceList() :
beagle.h
beagleGetScaleFactors() :
beagle.h
beagleGetSiteDerivatives() :
beagle.h
beagleGetSiteLogLikelihoods() :
beagle.h
beagleGetTransitionMatrix() :
beagle.h
beagleGetVersion() :
beagle.h
BeagleOpCodes :
beagle.h
beagleRemoveScaleFactors() :
beagle.h
beagleRemoveScaleFactorsByPartition() :
beagle.h
beagleResetScaleFactors() :
beagle.h
beagleResetScaleFactorsByPartition() :
beagle.h
BeagleReturnCodes :
beagle.h
beagleSetCategoryRates() :
beagle.h
beagleSetCategoryRatesWithIndex() :
beagle.h
beagleSetCategoryWeights() :
beagle.h
beagleSetEigenDecomposition() :
beagle.h
beagleSetPartials() :
beagle.h
beagleSetPatternPartitions() :
beagle.h
beagleSetPatternWeights() :
beagle.h
beagleSetStateFrequencies() :
beagle.h
beagleSetTipPartials() :
beagle.h
beagleSetTipStates() :
beagle.h
beagleSetTransitionMatrices() :
beagle.h
beagleSetTransitionMatrix() :
beagle.h
beagleUpdatePartials() :
beagle.h
beagleUpdatePartialsByPartition() :
beagle.h
beagleUpdateTransitionMatrices() :
beagle.h
beagleUpdateTransitionMatricesWithMultipleModels() :
beagle.h
beagleWaitForPartials() :
beagle.h
Generated on Thu Apr 19 2018 14:41:44 for BEAGLE by
1.8.14